朱允炆令张昺为北平布政使，谢贵、张信掌北平都指挥使司，以谢贵控制北平（今北京），另以都督宋忠、徐凯、耿瓛屯兵开平、临清、山海关一带，并调检燕府护卫军士，加强防燕措施。
有个传说很有意思：
相传朱棣刚出北平，就在今天东坝与南来之敌交锋，展开厮杀。这里是北平背负重山，面对平陆，诸山之水连河通海，坝河、亮马河、温榆河交汇处。朱棣骑一匹青骢马，被敌军追逼到一条河沟边。
眼看就要没命，情急之下他问坐骑：'你能跨过这沟，让我脱险吗？"说完一抖缰绳，这马驮着朱棣噌地一下连跨三道河沟，甩脱追兵，化险为夷，最后累死。朱棣这才得以连陷通州、蓟州、德州、济南、宿州、扬州，1402年六月攻占南京，七月宣布称帝，年号永乐。
迁都北平改为北京后，为纪念当年初师遇险，坐骑忠勇，就在东坝建了马神庙，塑马供于庙中，当神祭祀。传说立庙之后，那马活了，常在夜间糟践庄稼。农民不堪其苦，偷着将庙毁了。传说归传说，朱棣迁都北京后，东坝以其水草丰美，宜于牧养皇家马匹，而一度成为明王朝的御马苑。
这里每隔三四里建一个马厂，大大小小共有二十多个，养马若干，可谓遍地开花。每个马厂都有围墙，墙里盖有马棚，墙外草地平旷，马群悠闲自在。母马怀孕产崽，就盖了驹子房负责接生。
说起朱棣生命中的奇女子，当仁不让的是徐皇后，她可是大明鼎鼎有名的开国功臣徐达的女儿。这位徐皇后，能文能武，史称其“幼贞静，好读书，称女诸生”。“诸生”即秀才，就是说她是一位女秀才，有如此才华，自然传到朱元璋的耳朵里。
于是有一天，朱元璋找到徐达，对他说道：“你我布衣之交。”意思是说，你我当年为普通百姓时就结下深厚的友谊，不是今天的君臣关系这么简单。“何况自古以来，君臣相契便可结为姻亲。你的长女就嫁给我们家老四吧。”朱元璋和徐达是少年时一起放牛的伙伴，后来又一起打拼天下。徐达是开国第一功臣，被封为魏国公。
他们之间的关系，用今天北京话来形容就是“发小”。可是这时情况不一样了，一个成了皇帝，一个虽然立有赫赫战功，但毕竟也是臣子。朱元璋是皇上，这皇上亲自替儿子求亲，他的话可就是圣旨啊，作为臣子的徐达自然不敢有违。当然，他也没有理由违背。大家想想，谁要是和皇上攀上了亲家，那可是件光宗耀祖的大喜事啊，太有面子了。徐达连连谢恩，婚事就这样定了下来。
这一年朱棣十六岁，徐氏小他两岁，只有十四岁。徐达的这个女儿虽是将门之女，却读书识礼才华出众，洪武九年，册为燕王妃。深得她的婆婆马皇后的喜爱。
这位徐王妃，身体里流淌着大将徐达的血液，平常文静有加，但毕竟是将门之女。就在朱棣起兵造反的时候，朝廷派李景隆围攻北平，而此时的朱棣前往宁王朱权那里去求援，北京城空，危在旦夕。就是这位徐王妃，在危急之中披上战甲，挽救了北平。
因为当时李景隆的军队号称五十万，北平城在他日夜攻击之下，情势真是千钧一发。北平是元朝的大都，城墙高大，护城河宽水深，易守难攻。于是李景隆就下令军队主要攻击北平的九个城门，正南方的丽正门，就是今天的正阳门（俗称前门），是攻击的重点，当时情况更是十分危急。守城将士一面拼死抵抗，一面向王妃徐氏告急。
这位徐王妃，别看平时文静端庄，但毕竟是大将军徐达的女儿，所谓将门虎子，这女儿也巾帼不让须眉了。城里的男子都已经登城战斗了，没有后备的男子，于是她就亲自率领城中妇女，登城助战，奋力厮杀。她一登上城墙，守军的士气顿时大振，立刻就把朝廷军队攻城的气势给压了下去。
北平西边的阜成门，也是朝廷军队攻击的重点。据说部分朝廷军队一度在都督瞿能父子率领下已经攻入城门，但李景隆唯恐他们夺了头功，下令等待大军并进。结果燕军将士连夜在城墙上泼水，那时正是寒冬，水很块在夜里结成冰，第二天再战，城墙已经无法攀登了。
就这样，一座仅仅有守军万人的孤城，抵抗了数十万人的日夜进攻。
后来朱棣登基为帝，徐王妃自然就成为母仪天下的徐皇后。朱棣的皇位尚未做稳，急需用人之时，他选出了一个特殊的秘书班子，徐皇后为其分忧，采用夫人策略，在宫中隆重接见七位官员的夫人，这在当时是特例，是了不起的荣誉。
她还经常劝帝爱惜百姓，广求贤才，恩礼宗室，不要骄宠外戚。四十六岁那年，她因病去世，朱棣大为悲痛，谥曰仁孝皇后，此后的十几年再没立过皇后。可见徐皇后在明成祖心中的地位，没人能够取代。
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